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西安BD Rhapsody空間轉錄組測序服務

來源: 發布時間:2022-08-20

10xGenomics空間轉錄組用于文庫構建的每張載玻片上有四個捕獲區域,每個捕獲區域的大小為6.5x6.5mm,包含5000個被條形碼標記的點(barcodedspots),每個點的直徑為55μm,點和點之間中心的距離為100μm,并且每個點都有一個barcode序列。組織切片的細胞中會釋放出mRNA,遷移到每個spot的mRNA會被標記上相應的barcode序列,然后進行文庫構建并進行測序。根據數據的條形碼信息對數據進行分析,以確定哪些數據來自哪個位置,從而實現空間基因表達的可視化。從樣本處理到終端數據分析,只要您需要,烈冰提供全流程的無憂服務。西安BD Rhapsody空間轉錄組測序服務

10XGenomics和Drop-Seq的技術原理。是利用十字交叉的通道,從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠,縱向孔道輸入細胞,凝膠微珠與細胞碰撞后會吸附在凝膠微珠上,并通過微流控技術,將之輸入到油相孔道中。這時候,就形成了一個個油滴后輸出并收集在EP管中。每一個油滴中會落入一個細胞以及一個凝膠微珠,那么在每一個凝膠微珠中上長滿了不同的CellBarcode和UMIBarcode連接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,構成我們的捕獲凝膠微珠。而這個凝膠微珠抓手就會使用oligodT抓住mRNA構建文庫,進而完成細胞中RNA的捕獲過程。重慶scRNA空間轉錄組商業化服務烈冰引進國際主流空間轉錄組測序平臺,提供保留組織內部精細區域的空間信息的轉錄組測序。

所謂的高通量測序技術,又名大規模平行測序,是將DNA(或者cDNA)隨機片段化、加接頭,制備測序文庫,通過對文庫中數以萬計的克隆(colony)進行延伸反應,檢測對應的信號并獲取序列信息。與傳統測序法相比,高通量測序技術在處理大規模樣品時具有強大的優勢,又快(兩天)又多(數百萬克隆),成為目前組學研究的主要技術。空間轉錄組測序是一個系統的工程,開展項目前您可能會先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,如果匹配,實驗過程如何規劃,實驗平臺如何選擇,樣本如何制備,數據如何分析等等,而在這一切開始之前,我們的服務就已經開始了,從銷售到實驗到專業技術支持,我們開通全線對接渠道,幫助您快速定位項目訴求,提供從實驗設計到文章發表的全流程,我們始終是您貼心的科學合作伙伴。

單細胞測序是指針對單個細胞進行全轉錄組測序分析,可精確地描述每一個細胞的狀態,在異質性發育過程中具有不可忽視的應用價值。然而,單細胞測序無法給出固態異質化組織中細胞空間排布信息,對于揭示發育過程、病理微環境都存在很大的局限性。空間轉錄組測序以點陣形式記錄病理切片細胞的空間信息并進行測序,可以精確指示點陣內的全部基因表達情況。空間轉錄組測序的加入,無疑讓單細胞測序如虎添翼,更精確地勾勒了組織水平的異質性。測序的革新讓科學研究從個體基因差異逐漸轉為個體細胞的基因差異。

基因測序是基因檢測的方法之一,其又叫基因譜測序,是國際上公認的一種基因檢測標準。高通量測序技術是對傳統測序一次顛覆性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定,被稱為下一代測序技術(nextgenerationsequencing),足見其劃時代的改變,同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測序(deepsequencing)。基因測序相關產品和技術已由實驗室研究逐漸演變到臨床應用,可以說,基因測序技術將是下一個改變世界的技術。烈冰科技已建立了基于空間轉錄組的高通量測序實驗多平臺。西安烈冰科技空間轉錄組數據分析可視化

烈冰生物成立于2010年,專注于空間轉錄組測序領域科研服務。西安BD Rhapsody空間轉錄組測序服務

基于橋式PCR技術的簇生成可以將模版鏈迅速擴增成千上萬倍,保證過程中足夠的測序深度。測序時使用特殊標記的dNTP:1)堿基上通過敏感鍵修飾上不同的熒光基團,用于區分ATCG;2)3端使用疊氮基團封閉,保證一次循環只上一個dNTP。每一輪循環結束時,會通過高速熒光顯微鏡記錄熒光圖像,再通入試劑除去熒光基團和疊氮基團,開啟下一循環。通過分析讀取同一位點的熒光,實時獲取模版鏈的堿基序列。由于過程中使用的化學反應并不可控,隨著循環數的增大會出現不同步的情況,因此Illumina的讀長只能限制在200bp左右。西安BD Rhapsody空間轉錄組測序服務

上海烈冰生物醫藥科技有限公司一直專注于生物科技、醫藥科技、信息科技、計算機科技領域內的技術開發、技術服務、技術轉讓、技術咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調查(不得從事社會調查、社會調研、民意調查、民意測驗),從事貨物及技術的進出口業務,計算機、軟件及耗材(除專控),軟件開發【依法須經批準的項目,經相關部門批準后方可開展經營活動】,是一家醫藥健康的企業,擁有自己**的技術體系。公司目前擁有較多的高技術人才,以不斷增強企業重點競爭力,加快企業技術創新,實現穩健生產經營。公司業務范圍主要包括:單細胞測序,生物大數據云分析平臺,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序等。公司奉行顧客至上、質量為本的經營宗旨,深受客戶好評。公司深耕單細胞測序,生物大數據云分析平臺,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序,正積蓄著更大的能量,向更廣闊的空間、更寬泛的領域拓展。

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