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蘇州二代測序單細胞測序多組學測序

來源: 發布時間:2022-08-24

10XGenomics是一種基于drop的微流控技術,液體在配套芯片中的微管道中流動,因此細胞直徑會受到芯片中微管道直徑的限制,微流體通道的直徑約為50~60um,因此捕獲細胞的直徑不能超過40um。當細胞直徑過大時,容易出現管道堵塞,造成GEM生成失敗,對于神經科學研究和心血管疾病研究的老師而言,準備采用單細胞技術用于課題研究的時候,往往會遇到一個尷尬的問題,就是目標細胞,例如神經元細胞、成熟心肌細胞由于體積過大,不適用于10X單細胞技術。其中神經元細胞的直徑很大,直接超過了芯片中管道的直徑,雖然心肌細胞直徑低于50um,但是成熟心肌細胞的長度很長,有可能堵塞通道造成實驗失敗,這也是為什么現在很多已發表的心臟單細胞文章,主要研究方向是心臟發育的原因了,主要還是因為未發育成熟的心肌細胞比較小,不會出現堵塞管道的風險。因此可以考慮組織解離后過40um濾網,過濾掉大細胞,避免出現管道堵塞、實驗失敗的風險。此種方案的缺點是大細胞被過濾掉,丟失相關細胞數據;另外組織解離獲得高質量細胞懸液以后,繼續做細胞裂解抽細胞核,開展細胞核測序。具體可訪問烈冰官網給我們留言,烈小冰將安排專業技術為您詳細解答。烈冰單細胞多組學測序助您探究細胞類型特異性和基因調控網絡特征。蘇州二代測序單細胞測序多組學測序

單細胞測序龐大的數據烈冰生信團隊傾情研發的NovelBrain®生信大數據分析平臺,可實現零代碼操作、簡單方便:單細胞瀏覽器的操作簡單,不需要命令行操作。簡單拖拽、設置參數即可運行,即使生信0基礎用戶也可以運用自如;可視化展示海量結果文件:可視化展示Cluster的基因數,UMI數量、線粒體RNA占比信息;以及不同Cluster對應的細胞數量、基因表達量、RNA表達量、樣本細胞分布、線粒體RNA表達量等;3D立體展示,文章動圖先人一步:單細胞瀏覽器針對t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結果進行三維立體展示,更加直觀立體的觀察細胞分布和聚類情況。沈陽單細胞測序數據分析助力探索生命時空多維度的動態變化的生物學信息;助力醫療健康時代!

單細胞測序實驗再樣本細胞上機分選簽,需要對細胞數量、細胞活性進準判斷,這對SingleCell分選標記、建庫、下機數據的質量都具有著決定性的作用。如若細胞計數偏高,將會影響建庫的成功率;計數偏低,則會提高雙細胞的比例;而細胞活率過低,就會使測序數據的利用率大打折扣,因此把好單細胞懸液質量這一關尤為重要。而在鋪板過程中,由于不同操作人員手法具有不可避免的差異,不同的液體流速將直接影響單細胞的入孔效果。因此烈冰生物BDRhapsody單細胞分選平臺配套了專門定制的電動移液器,其具有PrimeTreat、CellLoad、BeadLoad、Wash、Lysis、Retrieval多種操作模式,來對應各種不同的操作。通過已經設定的程序來控制液體的流速,大幅度降低人為操作習慣帶來的差異,保證實驗操作的一致性。

從單細胞測序描述性分析轉向復雜樣本中不同細胞類型的功能解析,越來越需要一種多組學的細胞生物學視角。通過單細胞多組學——即對不同組學的數據集進行分析和整合——科學家能夠從同一個單細胞來源中檢測多種細胞特征。這些特征包括全轉錄組基因表達、細胞表面蛋白表達、免疫組庫序列(包括T細胞和B細胞受體)以及用于了解表觀基因組調控的開放染色質區域。隨著單個實驗可提供更多信息豐富的數據,研究人員的獲益更多,包括保留珍貴樣本、提高生產力、減少因批次效應引起的錯誤,并節省更多的高科技資源(從資助基金到人員時間)。烈冰科技已建立了多種國際和國內主流的高通量測序實驗平臺。

截至2022年6月,烈冰生物助力發表單細胞文章近40篇,從平臺應用比例來看,應用10X Genomics和BD Rhapsody兩大平臺發文比例各占50%左右,研究類型涵蓋疾病發展,靶點探索,免疫研究,神經發育,干細胞分化,植物發育,退行病變,糖尿病,COVID-19等等研究;從發表期刊水平來看,烈冰生物聯合發表的單細胞文章,CNS一區期刊占比在30%以上,其中包括immunity三篇,Nature子刊3篇(Nature cell biology,Nature Plants,Nature communication),風濕類領域ARD期刊1篇,CUT 1篇,Advanced Science多篇,IF大于10分以上文章占比高達68.5%,烈冰專屬單細胞測序服務團隊,將與您攜手譜寫下一篇“高分”新文章。高通量測序技術是對傳統測序一次突破性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定。寧波二代測序單細胞測序

烈冰生物全轉錄組測序通過雙文庫構建,實現多種RNA的一網打盡。蘇州二代測序單細胞測序多組學測序

烈冰生物成立于2010年,與時俱進,堅持為科研學者提供國際前沿的高通量測序實驗和深度的生物信息數據分析服務,已逐步發展為單細胞多組學檢測服務高新技術企業。專注于“單細胞測序系列技術服務”的專精領域,在上海、北京、廣州、西安和江西等地擁有數千平辦公場所,并布局多中心產品研發生產基地和營銷、運營中心。2016年起連續被評為上海市高新技術企業,60+項自主知識產權,轉化率近80%。產品覆蓋從單細胞測序,核測序,單細胞多組學,空間轉錄組測序等多組學聯合的實驗+數據分析全流程服務平臺。為600+國內高校和醫院、5000+深度合作學者用戶、10000+生命科學探索的重要科研項目在醫藥開發、科學研究、醫學及臨床研究,疾病分子標志物篩選、生命和神經發育研究等提供多層次、多組學檢測服務和解決方案,助力300+CNS國際學術期刊文章發表,30+篇單細胞技術聯合(助力)發文,IF10+文章占比>65%。蘇州二代測序單細胞測序多組學測序

上海烈冰生物醫藥科技有限公司屬于醫藥健康的高新企業,技術力量雄厚。公司致力于為客戶提供安全、質量有保證的良好產品及服務,是一家有限責任公司(自然)企業。公司始終堅持客戶需求優先的原則,致力于提供高質量的單細胞測序,生物大數據云分析平臺,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序。烈冰生物自成立以來,一直堅持走正規化、專業化路線,得到了廣大客戶及社會各界的普遍認可與大力支持。

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