Chip-Seq 是指通過染色質免疫共沉淀技術（ChIP）特異性地富集目的蛋白結合的DN**段，并對其進行純化和文庫構建；然后對富集得到的DN**段進行高通量測序，通過將獲得的數百萬條序列標簽精確定位到基因組上，從而獲得全基因組范圍內與組蛋白、轉錄因子等互作的 DNA 區段信息，是目前在全基因組水平研究蛋白結合靶DNA序列的重要手段，為轉錄因子、組蛋白修飾、核小體定位等表觀遺傳學的研究提供有效方法。
應用領域
1、確定組蛋白修飾的位置及其與基因表達的關系。
2、完成對轉錄因子及其它蛋白在基因組上結合位點的精細定位。
3、研究特定的核小體或組蛋白的分布。 通過甲基化數據，篩選疾病耐藥的差異甲基化。江蘇cfDNA甲基化技術服務歡迎咨詢
技術優勢
1、ChIP-Seq 能實現真正的全基因組分析。目前所能獲得的芯片上固定的探針只能**全基因組部分序列，所獲得的雜交信息具有偏向性。
2、對于結合位點分析，ChIP-Seq 通過尋找“峰”，結合分辨率可精確到10~30 bp，而芯片上探針由于長度所限，無法精確定位，即使目前比較高水平的商業芯片都無法提供可與ChIP-Seq 媲美的分辨率。
3、是所需樣本數量。ChIP-chip 需要多達4~5 μg?的起始樣本，在雜交之前需要進行LM-PCR，但可能導致背景增高，競爭性擴增等導致假陽性。而ChIP-Seq *需要納克級起始材料，如SOLiD 起始材料可低至20ng。 江蘇cfDNA甲基化技術服務歡迎咨詢細胞、全血、組織樣本干冰運輸。
甲基化DNA免疫沉淀測序（MethylatedDNAImmunoprecipitationSequencing，MeDIP-Seq）是通過5mC特異性抗體富集甲基化的DN**段，然后結合高通量測序技術在全基因組水平上以較小的數據量，快速、高效地尋找甲基化區域。可廣泛應用于甲基化與疾病關系研究。技術優勢全基因組范圍鑒定甲基化修飾區域針對性檢測基因組內具有甲基化修飾的區域與WGBS技術相比，成本更低科學方案設計從項目背景了解、協助方案設計、實驗材料選取、建庫測序，到數據分析每個項目有特定的科學問題；需要專業、有價值的建議；科學、縝密的設計及時高效的溝通；以保障高質量研究成果樣本要求：基因組DNA:>=3ug；樣品濃度>50ng/ul；無RNA和蛋白污染建庫測序：測序策略：IlluminaHiSeq,PE150。
N6-甲基脫氧腺苷(6mA)是原核生物和真核生物的DNA修飾類型之一，在細菌、藻類及植物基因組中***存在，在DNA錯配修復、染色體分離和毒力調節中發揮作用。6mA免疫沉淀測序(6mA-IPSeq)通過特異性抗體富集6mA甲基化的DN**段，然后結合高通量測序技術在全基因組水平上以較小的數據量，快速、高效地尋找6mA甲基化區域。技術優勢全基因組范圍鑒定6mA甲基化修飾區域技術方法適合所有物種(一般推薦藻類及植物)科學方案設計從項目背景了解、協助方案設計、實驗材料選取、建庫測序，到數據分析每個項目有特定的科學問題；需要專業、有價值的建議；科學、縝密的設計及時高效的溝通；以保障高質量研究成果樣本要求：基因組DNA:>=3ug；樣品濃度>50ng/ul；無RNA和蛋白污染建庫測序：測序策略：IlluminaHiSeq,PE150。 CpG島常位于基因轉錄調控區附近。
cfDNA，cellfreeDNA，就是血液中游離的自身DNA，這些DNA多是從身體的細胞或者白血球破裂釋放出來的，基本上都是無害的，不用多久會被自身清理掉。不過值得一提的是，當孕婦懷孕的時候，胎兒的DNA也會同時釋放到母親的血液里頭去，這是當前火熱的無創唐氏篩查的基礎。通過抽取母親的外周血測序分析其中的游離DNA就可以判斷胎兒是否存在整個染色體或者大片段DNA的變異。有研究已經證實，**患者外周血中的cfDNA總量，要高于健康人。通過這一點，雖然不能武斷的說cfDNA能成為**標志物，但是cfDNA的含量增多，能起到一個較好的提示作用，作為一個初篩的手段。基于cfDNA的液態活檢中，盡管ctDNA在**診斷中的應用是當下cfDNA*****，研究**深入的分支。但是，cfDNA作為液態活檢，不只是局限于**學。例如，有研究報道對于接受***移植手術的病人，可以通過監測術后外周血中具有捐獻者基因特征，片段化的cfDNA含量變化，來評估移植***的排斥情況。 芯片數據如何與二代、三代數據整合。江蘇cfDNA甲基化技術服務歡迎咨詢
ATAC-seq實驗過程短，從實驗到分析可達2周。江蘇cfDNA甲基化技術服務歡迎咨詢
2019國自然基金解析—甲基化研究專題。從生命科學部和醫學科學部總體來看：2019年度，生命科學部獲自然科學基金委批準資助6478項（不含杰出青年基金項目），批準資助金額共計，單項平均資助金額。2019年度，醫學科學部共批資助10138項（不含杰出青年基金項目），批準資助金額共計，單項平均資助金額。從甲基化研究方向來看，與甲基化研究相關的項目總數達283項，項目總金額超過12669萬元。其中生命科學部項目總數62項，項目金額3235萬元，醫學科學部項目總數221項，項目金額9434萬元。從2011-2019年甲基化研究方向的項目金額和項目數目分析，整體呈上升趨勢；從醫學科學部來看，甲基化研究項目獲批數量221項，項目金額達到9434萬，較之2018年度項目獲批金額（7166萬元）上升趨勢尤為明顯，可以看出，甲基化研究日益成為國自然的研究熱點。 江蘇cfDNA甲基化技術服務歡迎咨詢