3D數(shù)字PCR為液體活檢提供技術(shù)支持液體活檢是一種非侵入性的檢測基因及臨床效果的一種方法,目前可能正在開展有關(guān)3D數(shù)字PCR在在液體活檢中的療效,為后期臨床提供更多可靠的指導(dǎo)作用。報道稱“無創(chuàng)傷性肺檢測技術(shù)即將登陸中國”。隨著基因檢測技術(shù),如類似3D數(shù)字PCR技術(shù)的發(fā)展,推動我們將進入了“DNA的應(yīng)用商城”這樣的新時代,如23andme、華大基因等專業(yè)的檢測服務(wù)機構(gòu),提供更加專業(yè)的基因檢測結(jié)果,經(jīng)基因報告解讀師或遺傳咨詢師進行通俗的解讀,讓我們每一個人都能夠了解自己的基因,擁有自己的“生命之書”,讓我們更加健康的生活。精細醫(yī)療其實本質(zhì)是應(yīng)用生物學(xué)信息與大數(shù)據(jù)科學(xué)的交叉發(fā)展的新型醫(yī)學(xué)概念與醫(yī)療模式。對于精細醫(yī)療,重點在于“精細”,不僅只是簡單的基因測序如此簡單,更需要精細的診斷與精細的。從市場規(guī)模來看,目前數(shù)字PCR市場規(guī)模并不大,全球約1.5億至2.5億美元。美國數(shù)字PCR儀器
根據(jù)泊松分布的定義和適用條件可知,如果我們設(shè)微液滴總數(shù)為N,投入的靶序列拷貝數(shù)為M,那么“每個微液滴中的靶序列拷貝數(shù)”的概率分布是近似滿足泊松分布的。理解之前,首先要明確一點,在檢測的過程中,并不是說一個樣本中檢測到了幾個亮點,這個反應(yīng)當(dāng)中就有幾個目標(biāo)基因的拷貝。因為目標(biāo)基因的片段,在微滴當(dāng)中的分布,是符合泊松分布的(也就是說進不進的概率相等,并且相互獨立)。所以,一個發(fā)光的微滴中,可能有一個或者三個四個,甚至更多個目標(biāo)基因的拷貝。因此,發(fā)光的微滴數(shù)與原始的基因拷貝數(shù)并不是一對一的對應(yīng)關(guān)系。美國數(shù)字PCR儀器臻準(zhǔn)推出新款數(shù)字PCR產(chǎn)品:AccuONE2.0數(shù)字PCR系統(tǒng)。
使用ddPCR的一個主要優(yōu)點在于,定量不是相對的。微滴式數(shù)字PCR計算事件的數(shù)量,因此可以確定檢測極限和比較低起始量,以便達到所需的靈敏度。在連續(xù)監(jiān)控或比較不同患者的效果時,這可以更準(zhǔn)確地比較負荷,因為所測得的豐度不是相對的。經(jīng)過實驗證實,ddPCRKRASG12/G13ScreeningKit也能夠檢測患者cfDNA樣品中的KRAS突變(圖2)。這些患者的血漿樣品購自ConversantBio和ProMedDx,之前已通過FFPE基因分型被分為KRAS突變陽性或陰性。歡迎咨詢廣州雙螺旋科學(xué)儀器有限公司。
dPCR在使用過程中需要特別注意體積誤差造成的結(jié)果偏差。體積誤差對于測量拷貝數(shù)濃度會產(chǎn)生偏差。目前dPCR中體積優(yōu)化方法以光學(xué)顯微鏡觀測為主。分散體積的差異會增加拷貝數(shù)結(jié)果的不確定性,Emslie等使用光學(xué)顯微鏡縱向拍照比較圖片邊緣的微小差異,考察了數(shù)字PCR系統(tǒng)中每個微孔內(nèi)和孔與孔間的體積差異對實驗結(jié)果的影響程度。Corbisier等使用微滴數(shù)字PCR對6種不同質(zhì)量分?jǐn)?shù)棉籽粉質(zhì)粒DNA標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)[ERM-AD623a-f,濃度范圍(10~10)copies/ul]進行分析,優(yōu)化了液滴體積得到相應(yīng)校正因子,并使用該校正因子發(fā)現(xiàn)并校準(zhǔn)了運行軟件中液滴體積不變的假設(shè)而引起的數(shù)據(jù)偏離,數(shù)據(jù)結(jié)果的一致性有明顯提高。數(shù)字PCR應(yīng)用前景廣闊,可用于病原微生物檢測、基因檢測、無創(chuàng)產(chǎn)前篩查、測序結(jié)果驗證等領(lǐng)域。
數(shù)字PCR平臺的評價指標(biāo)有:分割單元數(shù),熒光通道數(shù),操作復(fù)雜性和污染風(fēng)險。但是重要的是檢測準(zhǔn)確性,評估數(shù)字PCR平臺的一種方法是使用多個數(shù)字PCR平臺互相驗證,另一種方法是使用定值準(zhǔn)確的標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)。目前的三代的PCR技術(shù)各有各的優(yōu)缺點,也各有各的應(yīng)用領(lǐng)域,并不是一代取代一代的關(guān)系。技術(shù)的不斷進步給PCR技術(shù)注入了新的活力,使其能解鎖一個又一個的應(yīng)用方向,使核酸檢測更方便、更準(zhǔn)確。目前dPCR儀器的價格仍然十分昂貴,但隨著系統(tǒng)加工工藝的改進以及使用較便宜的材料,聚合成更小的體積[556],其價格將會不斷的降低,使其應(yīng)用到更多的檢測中。數(shù)字PCR在檢測珍貴樣品和樣品核酸存在降解時具有明顯的優(yōu)勢。雙螺旋生物儀器數(shù)字PCR市場前景
數(shù)字PCR的應(yīng)用甚廣,除了可應(yīng)用于進行突變的檢測以外,也可運用于基因擴增的檢測。美國數(shù)字PCR儀器
作為時下的熱點技術(shù),數(shù)字PCR是將核酸樣品分配到大量單獨、平行的微反應(yīng)單元(nL,納升級別)中,使得每個反應(yīng)單元中盡可能含有1個模板分子,并在此基礎(chǔ)上進行擴增、檢測和分布統(tǒng)計,從而實現(xiàn)靶標(biāo)分子的比較 計數(shù)。(圖:數(shù)字PCR技術(shù)原理)根據(jù)微反應(yīng)單元的不同形式,數(shù)字PCR產(chǎn)品可分為微板式、微滴式和芯片式等。目前,市場上主要的數(shù)字PCR產(chǎn)品主要是基于微滴式和芯片式,如Bio-Rad公司的QX200微滴式系統(tǒng)和ThermoFisher公司的QuantStudio系統(tǒng)等。與一、二代PCR技術(shù)相比,數(shù)字PCR具有很多優(yōu)勢:一是特異性、靈敏性均有顯著提高;二是在不依賴內(nèi)參和標(biāo)準(zhǔn)曲線的前提下,可直接得到比較 量化指標(biāo);三是微反應(yīng)單元相互獨立、封閉,避免了PCR抑制劑及不同核酸分子擴增產(chǎn)物間的相互干擾,準(zhǔn)確度和可重復(fù)性較高。美國數(shù)字PCR儀器
廣州雙螺旋科學(xué)儀器有限公司致力于精細化學(xué)品,以科技創(chuàng)新實現(xiàn)高質(zhì)量管理的追求。雙螺旋科學(xué)儀器作為精細化學(xué)品的企業(yè)之一,為客戶提供良好的數(shù)字PCR,純水機,病理切片機,倍性分析儀。雙螺旋科學(xué)儀器不斷開拓創(chuàng)新,追求出色,以技術(shù)為先導(dǎo),以產(chǎn)品為平臺,以應(yīng)用為重點,以服務(wù)為保證,不斷為客戶創(chuàng)造更高價值,提供更優(yōu)服務(wù)。雙螺旋科學(xué)儀器創(chuàng)始人姜艷,始終關(guān)注客戶,創(chuàng)新科技,竭誠為客戶提供良好的服務(wù)。