轉(zhuǎn)錄組分析指對(duì)細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的分析。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序一般是對(duì)用多聚胸腺嘧啶(oligo-dT)進(jìn)行親和純化的RNA聚合酶II轉(zhuǎn)錄生成的成熟mRNA和ncRNA進(jìn)行高通量測(cè)序。相對(duì)于傳統(tǒng)的芯片雜交平臺(tái),轉(zhuǎn)錄組測(cè)序無(wú)需預(yù)先針對(duì)已知序列設(shè)計(jì)探針,即可對(duì)任意物種的整體轉(zhuǎn)錄活動(dòng)進(jìn)行檢測(cè),提供更精確的數(shù)字化信號(hào),是目前深入研究轉(zhuǎn)錄組復(fù)雜性的強(qiáng)大工具。FFPE空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)原理 為同時(shí)獲得空間表達(dá)和組織學(xué)背景信息,該方案首先將FFPE組織切片置于Visium基因芯片上進(jìn)行組織學(xué)染色和成像,然后利用切片下方Visium基因芯片上的探針進(jìn)行表達(dá)定量。空間轉(zhuǎn)錄組可展示組織切片中不同區(qū)域的基因表達(dá)情況,揭示精細(xì)病理區(qū)域的信號(hào)通路。合肥BD空間轉(zhuǎn)錄組多組學(xué)測(cè)序
解決空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)分析中由于超大數(shù)據(jù)量、超高的質(zhì)控要求以及繁多分析需求而引起的分析困難,做到快速可定制化完成空間轉(zhuǎn)錄組分析;擁有行業(yè)先進(jìn)的3DHISTECH公司的PANNORAMIC系列的數(shù)字切片掃描儀,可以同時(shí)實(shí)現(xiàn)明場(chǎng)與熒光場(chǎng)下冷凍切片的快速掃描成像;Z-Stack多層聚焦掃描及Extended Focus 景深擴(kuò)展多層融合掃描模式,進(jìn)一步提升分辨率和清晰度,保證切片高分辨的數(shù)字圖像信息精細(xì)采集;能夠滿足針對(duì)分析結(jié)果中感興趣基因的RNA-FISH驗(yàn)證以及組織切片的免疫組化的高清成像,獲取表達(dá)與定位信息。烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組多組學(xué)測(cè)序烈冰斥巨資引進(jìn)Novaseq6000,開(kāi)啟更大通量測(cè)序新紀(jì)元。
10XVisium的實(shí)驗(yàn)主要分為兩部分:組織學(xué)板塊和組學(xué)板塊。組織學(xué)板塊包括樣品的包埋、切片、固定、染色及成像,記錄切片的形態(tài)學(xué)信息;組學(xué)板塊包括cDNA的合成、擴(kuò)增、接頭連接和測(cè)序,記錄切片的轉(zhuǎn)錄本信息和空間位置信息。具體實(shí)驗(yàn)流程如下:A、切片制備和優(yōu)化:取新鮮組織、冷凍、切片,并進(jìn)行HE染色成像,優(yōu)化確定切片是否覆蓋靶向區(qū)域。B、切片固定和透化:將組織切片放置在含有與RNA結(jié)合捕獲探針的載玻片上,并進(jìn)行固定和透化,使細(xì)胞中的mRNA得到釋放,并結(jié)合到相應(yīng)的捕獲探針上,從而獲取基因表達(dá)信息。C、逆轉(zhuǎn)和文庫(kù)構(gòu)建:以捕獲的RNA為模板,進(jìn)行cDNA合成,和測(cè)序文庫(kù)制備。D、高通量上機(jī)測(cè)序:對(duì)制備好的測(cè)序文庫(kù),進(jìn)行二代高通量短讀長(zhǎng)測(cè)序。E、數(shù)據(jù)可視化分析:結(jié)合HE結(jié)果,確定哪些基因有表達(dá),表達(dá)量高低,以及這些基因的空間位置信息
10XGenomics和Drop-Seq的技術(shù)原理。是利用十字交叉的通道,從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠,縱向孔道輸入細(xì)胞,凝膠微珠與細(xì)胞碰撞后會(huì)吸附在凝膠微珠上,并通過(guò)微流控技術(shù),將之輸入到油相孔道中。這時(shí)候,就形成了一個(gè)個(gè)油滴后輸出并收集在EP管中。每一個(gè)油滴中會(huì)落入一個(gè)細(xì)胞以及一個(gè)凝膠微珠,那么在每一個(gè)凝膠微珠中上長(zhǎng)滿了不同的CellBarcode和UMIBarcode連接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,構(gòu)成我們的捕獲凝膠微珠。而這個(gè)凝膠微珠抓手就會(huì)使用oligodT抓住mRNA構(gòu)建文庫(kù),進(jìn)而完成細(xì)胞中RNA的捕獲過(guò)程。十二年測(cè)序經(jīng)驗(yàn),累計(jì)服務(wù)與5000余項(xiàng)重要科研項(xiàng)目。
烈冰生物已空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序服務(wù)提供從一個(gè)組織切片樣本中獲取包括空間信息在內(nèi)的全部轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),從而可以區(qū)分和定位功能基因在特定組織區(qū)域內(nèi)的活躍表達(dá)。其可以檢測(cè)組織樣本中的所有基因活動(dòng),并繪制活動(dòng)發(fā)生的位置,這將有助于科學(xué)家更好地構(gòu)建生物圖譜,并進(jìn)一步理解疾病和生物學(xué)過(guò)程。目前,空間轉(zhuǎn)錄組主要應(yīng)用于多種疾病、免疫、發(fā)育、神經(jīng)和病理學(xué)等研究領(lǐng)域。烈冰生物具有專業(yè)的實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)、豐富的切片經(jīng)驗(yàn),配置了國(guó)際主流的儀器設(shè)備,實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)針對(duì)不同組織類型優(yōu)化完善實(shí)驗(yàn)方案,并制定了嚴(yán)謹(jǐn)規(guī)范的實(shí)驗(yàn)室SOP流程,保證空間轉(zhuǎn)錄組切片的質(zhì)量,全優(yōu)保障測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量。全線搭建10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序平臺(tái)。無(wú)錫scRNA空間轉(zhuǎn)錄組平臺(tái)
空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)的迅速發(fā)展和應(yīng)用推廣,為從多維度揭示疾病進(jìn)展提供了強(qiáng)有力的工具。合肥BD空間轉(zhuǎn)錄組多組學(xué)測(cè)序
空間轉(zhuǎn)錄組研究的的必耍性:研究單細(xì)胞是想要探究細(xì)胞間的異質(zhì)性,但是常規(guī)的單細(xì)胞是將細(xì)胞解離成單細(xì)胞懸液,然后利用單細(xì)胞分離技術(shù)(微孔,微板,液滴)等方法實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞建庫(kù),這里比較大的問(wèn)題是是細(xì)胞失去了原本在組織的空間信息。然而這個(gè)空間信息在實(shí)際研究中是非常重要。特別是在研究細(xì)胞命運(yùn)機(jī)制及細(xì)胞譜系發(fā)生空間位置的信息顯得尤為重要,因此發(fā)展空問(wèn)轉(zhuǎn)錄組技術(shù)實(shí)現(xiàn)細(xì)胞的位置信息的保留,對(duì)研究此類細(xì)胞狀態(tài)尤為必要。合肥BD空間轉(zhuǎn)錄組多組學(xué)測(cè)序
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司是一家有著雄厚實(shí)力背景、信譽(yù)可靠、勵(lì)精圖治、展望未來(lái)、有夢(mèng)想有目標(biāo),有組織有體系的公司,堅(jiān)持于帶領(lǐng)員工在未來(lái)的道路上大放光明,攜手共畫(huà)藍(lán)圖,在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康行業(yè)中積累了大批忠誠(chéng)的客戶粉絲源,也收獲了良好的用戶口碑,為公司的發(fā)展奠定的良好的行業(yè)基礎(chǔ),也希望未來(lái)公司能成為行業(yè)的翹楚,努力為行業(yè)領(lǐng)域的發(fā)展奉獻(xiàn)出自己的一份力量,我們相信精益求精的工作態(tài)度和不斷的完善創(chuàng)新理念以及自強(qiáng)不息,斗志昂揚(yáng)的的企業(yè)精神將引領(lǐng)上海烈冰生物醫(yī)藥科技供應(yīng)和您一起攜手步入輝煌,共創(chuàng)佳績(jī),一直以來(lái),公司貫徹執(zhí)行科學(xué)管理、創(chuàng)新發(fā)展、誠(chéng)實(shí)守信的方針,員工精誠(chéng)努力,協(xié)同奮取,以品質(zhì)、服務(wù)來(lái)贏得市場(chǎng),我們一直在路上!